Gon é um garoto que nunca conheceu seu pai e sua mãe faleceu quando ele era muito pequeno, sendo cuidado por sua tia que para ele é sua mãe. Certo dia Gon descobre que seu pai ainda está vivo e que é um Hunter, então Gon decide sair de sua ilha para virar um Hunter e conhecer seu pai. Muitos outros personagens aparecem como: Kurapika, que foi o único sobrevivente de seu clã que foi massacrado pelo Genei Ryodan e deseja vingança, Killua um jovem garoto que é da famosa família de assassinos Zoldick, Leorio que deseja se tornar Hunter para ganhar muito dinheiro e virar médico.